Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms