Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms