Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms