Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp12Q6P5B0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp12Q6P5B0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms