Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Soga3Q6NZL0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms