Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rprd2Q6NXI6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms