Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CltbQ6IRU5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CltbQ6IRU5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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