Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scaf8Q6DID3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms