Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sv2cQ69ZS6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sv2cQ69ZS6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms