Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CltcQ68FD5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CltcQ68FD5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms