Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja3Q64448 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms