Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms