Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ScxQ64124 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ScxQ64124 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ScxQ64124 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms