Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms