Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim28Q62318 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim28Q62318 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim28Q62318 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim28Q62318 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim28Q62318 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim28Q62318 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim28Q62318 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim28Q62318 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim28Q62318 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim28Q62318 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim28Q62318 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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