Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms