Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamb3Q61087 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamb3Q61087 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms