Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms