Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms