Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnk2a1Q60737 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms