Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprnQ60673 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms