Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms