Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg7Q5RJH6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms