Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms