Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clhc1Q5M6W3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms