Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZK1

Cep44, Centrosomal protein of 44 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep44Q5HZK1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep44Q5HZK1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep44Q5HZK1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms