Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm2Q5FW85 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm2Q5FW85 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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