Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam208bQ5DTT3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms