Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa20Q45VN2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa20Q45VN2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms