Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms