Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ankrd53Q3V0J4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ankrd53Q3V0J4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ankrd53Q3V0J4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ankrd53Q3V0J4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ankrd53Q3V0J4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ankrd53Q3V0J4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ankrd53Q3V0J4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ankrd53Q3V0J4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ankrd53Q3V0J4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ankrd53Q3V0J4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ankrd53Q3V0J4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ankrd53Q3V0J4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ankrd53Q3V0J4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ankrd53Q3V0J4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ankrd53Q3V0J4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms