Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms