Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clpsl2Q3UW21 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms