Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms