Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc4Q3UP24 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms