Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms