Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms