Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms