Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pid1Q3UBG2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pid1Q3UBG2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms