Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms