Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms