Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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