Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hvcn1Q3U2S8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms