Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc174Q3U155 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms