Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms