Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms