Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms