Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc136Q3TVA9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms