Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt2Q3TTY5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt2Q3TTY5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt2Q3TTY5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt2Q3TTY5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt2Q3TTY5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt2Q3TTY5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt2Q3TTY5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt2Q3TTY5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt2Q3TTY5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt2Q3TTY5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt2Q3TTY5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt2Q3TTY5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt2Q3TTY5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt2Q3TTY5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt2Q3TTY5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt2Q3TTY5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms