Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms